La Dirección General de Investigación en Salud, Formación y Acreditación coordina tareas de inspección, control, autorización, acreditación y registro de centros sanitarios, así como desarrollo de políticas de formación sanitaria especializada, y promoción de políticas de investigación, entre otras. Así mismo, también gestiona la Fundación Instituto de Investigación Sanitaria Illes Balears, el Comité de Ética de la Investigación de las Illes Balears, la Biblioteca Virtual de Ciencias de la Salud de las Illes Balears, la coordinación de Trasplantes de las Illes Balears, además del Registro de Voluntades Anticipadas.